Как отбить деньги за обучение на курсе машинного? Есть вариант. Рассказываем

В начале 2025 года фонд Марка Цукерберга и Присциллы Чан анонсировали Billion Cells Project. Инициатива по секвенированию миллиарда клеток и формированию огромного датасета. Всё — ради рождения AI Virtual Cell.

Виртуальная клетка — мечта многих. Но идея эта не нова: прежде тоже пытались строить клеточные модели, основанные на правилах и диффурах. К примеру, в 2012 году ученые сделали математическую модель Mycoplasma genitalium.

Нынче под виртуальной клеткой подразумевают AI-модели. С их помощью можно будет заменить мокрые эксперименты прогнозами AI. Например, симулировать in silico поведение онкоклетки в ответ на терапию. Ключевые данные, на которых обучаются современные модели, — секвенирование единичных клеток. Только сингл селл с миллионами клеток обеспечивает тот масштаб, когда проявляются преимущества LLM.

Цукерберг и его супруга не единственные, кто хотят обзавестись виртуальной клеткой. Такие разработки имеются у DeepMind, Noetik и Xaira. Этим же занимается Arc Institute.

Arc тоже начал с масштабной генерации данных и запустил свой Virtual Cell Atlas (более 300 млн клеток), чтобы на его основе тренировать модели. Совсем недавно, в конце июня, представили первый шаг на пути к виртуальной клетке — инструмент State, который предсказывает изменения экспрессии генов после воздействия лекарств, цитокинов, выключения генов. А еще через пару дней объявили о старте ежегодного конкурса Virtual Cell Challenge (VCC), где мы и предлагаем поучаствовать. Призовой фонд — $175К, спонсоры — Nvidia, 10X, Ultima.

Машинлернеры Arc не скрывают, что хотят повторить эффект CASP — соревнования, благодаря которому получился AlphaFold. В рамках VCC 2025 участники будут состязаться в разработке ML-моделей для прогнозирования последствий пертурбаций — нокдауна генов или терапии препаратами. Бейзлайн — State. А еще они хотят сформировать комьюнити и заложить стандарты отрасли. Для конкурса исследователи Arc собрали экспериментальные scRNA-seq данные 300 тыс. клеток линии H1 hESCs с сайленсингом 300 генов с помощью CRISPRi.

Соревнование будет идти с июня по декабрь, так что вполне можно успеть. Вот он, роадмап на лето: учишь Python, учишь ML, делаешь виртуальную клетку и денюжки