#پادکست
اپیزود بیستم و دوم، ششمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
در این فصل موضوعات عمومی تر در حوزه ترویج علم را میخوایم پوشش بدیم و با همکاری فرزاد بیک پور و مریم توحیدی نیا (یه تیم جوان و پرانرژی) چندین مقاله از سری مقالات ده قانون ساده از مجله PLOS Computational Biology را مرور کنیم. در هر قسمت یه مهمون هم به جمعمون اضافه میشه تا بتونیم از تجربیاتش در مورد موضوع مورد بحث مطلع بشیم.
امیدوارم این فصل از پادکست هم مورد پسند شنوندگان پادکست قرار بگیره و نظراتتون از نحوه اجرا و محتوای این اپیزود را با ما در میان بگذارید.
فصل سوم
قسمت بیستم و دوم:
انتخاب استاد راهنما
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
حسام منتظری
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/yrav8h4x
@JafaRiLab
اپیزود بیستم و دوم، ششمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
در این فصل موضوعات عمومی تر در حوزه ترویج علم را میخوایم پوشش بدیم و با همکاری فرزاد بیک پور و مریم توحیدی نیا (یه تیم جوان و پرانرژی) چندین مقاله از سری مقالات ده قانون ساده از مجله PLOS Computational Biology را مرور کنیم. در هر قسمت یه مهمون هم به جمعمون اضافه میشه تا بتونیم از تجربیاتش در مورد موضوع مورد بحث مطلع بشیم.
امیدوارم این فصل از پادکست هم مورد پسند شنوندگان پادکست قرار بگیره و نظراتتون از نحوه اجرا و محتوای این اپیزود را با ما در میان بگذارید.
فصل سوم
قسمت بیستم و دوم:
انتخاب استاد راهنما
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
حسام منتظری
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/yrav8h4x
@JafaRiLab
Castbox
Episode 22 - Choosing a PhD supervisor (انتخاب استاد راهنما)
<p>
</p><p>به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید</p><p>فصل سوم</p><p>
</p><p>قسمت بیستم و دوم:</p><p><strong>انتخاب استاد راهن...
</p><p>به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید</p><p>فصل سوم</p><p>
</p><p>قسمت بیستم و دوم:</p><p><strong>انتخاب استاد راهن...
👍3❤1
#آگهی
👇👇👇
پست زیر به درخواست یکی از همکاران آورده شده است و محتوای آن ارتباطی با @JafaRiLab ندارد
👇👇👇
👇👇👇
پست زیر به درخواست یکی از همکاران آورده شده است و محتوای آن ارتباطی با @JafaRiLab ندارد
👇👇👇
Forwarded from RSG - Iran
🔸رویداد افتتاحیه شاخه‌ی دانشجویی ISCB در ایران
با حضور دکتر مهدی صادقی، رئیس انجمن بیوانفورماتیک ایران
دکتر علی شریفی زارچی، هیئت علمی دانشگاه صنعتی شریف و استاد ناظر انجمن
دکتر محمد لطف‌اللهی، استاد دانشگاه کمبریج انگلستان و محقق موسسه Sanger
دکتر احسان‌الدین عسگری، محقق موسسه Helmholtz آلمان
🕓 زمان: یکشنبه ۱۴ آبان‌ماه، ساعت ۱۶ الی ۱۸
📍مکان: دانشکده کامپیوتر دانشگاه صنعتی شریف - سالن خوارزمی
شرکت به صورت حضوری و آنلاین برای عموم آزاد و رایگان می‌باشد.
⚡ثبت‌نام محدود
از طریق : فرم ثبت نام
🔔
با حضور دکتر مهدی صادقی، رئیس انجمن بیوانفورماتیک ایران
دکتر علی شریفی زارچی، هیئت علمی دانشگاه صنعتی شریف و استاد ناظر انجمن
دکتر محمد لطف‌اللهی، استاد دانشگاه کمبریج انگلستان و محقق موسسه Sanger
دکتر احسان‌الدین عسگری، محقق موسسه Helmholtz آلمان
🕓 زمان: یکشنبه ۱۴ آبان‌ماه، ساعت ۱۶ الی ۱۸
📍مکان: دانشکده کامپیوتر دانشگاه صنعتی شریف - سالن خوارزمی
شرکت به صورت حضوری و آنلاین برای عموم آزاد و رایگان می‌باشد.
⚡ثبت‌نام محدود
از طریق : فرم ثبت نام
🔔
#پادکست
اپیزود بیستم و سوم، هفتمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
فصل سوم
قسمت بیستم و سوم:
نوشتن مقاله علمی
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
علیرضا تهرانی بقا
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/ysfxrrxw
@JafaRiLab
اپیزود بیستم و سوم، هفتمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
فصل سوم
قسمت بیستم و سوم:
نوشتن مقاله علمی
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
علیرضا تهرانی بقا
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/ysfxrrxw
@JafaRiLab
Castbox
Episode 23 - Structuring papers (نوشتن مقاله علمی)
<p>به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید</p><p>فصل سوم</p><p> </p><p>قسمت بیستم و سوم:</p><p><strong>نوشتن مقاله علمی</strong></p><p...
👍2
#پادکست
اپیزود بیستم و چهارم، هشتمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
فصل سوم
قسمت بیستم و چهارم:
انتشار مقاله علمی
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
حمیدرضا بقایی
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/yulfughx
@JafaRiLab
اپیزود بیستم و چهارم، هشتمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
فصل سوم
قسمت بیستم و چهارم:
انتشار مقاله علمی
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
حمیدرضا بقایی
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/yulfughx
@JafaRiLab
Castbox
Episode 24 - Getting published (انتشار مقاله علمی)
<p>به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید</p><p>فصل سوم</p><p> </p><p>قسمت بیستم و چهارم:</p><p><strong>انتشار مقاله علمی</strong></p...
👍1
#آگهی
👇👇👇
پست زیر به درخواست یکی از همکاران آورده شده است و محتوای آن ارتباطی با @JafaRiLab ندارد
👇👇👇
https://jobs.helsinki.fi/job/Helsinki-Doctoral-Researchers-in-Molecular-Medicine-and-Life-Sciences/785508702/
👇👇👇
پست زیر به درخواست یکی از همکاران آورده شده است و محتوای آن ارتباطی با @JafaRiLab ندارد
👇👇👇
https://jobs.helsinki.fi/job/Helsinki-Doctoral-Researchers-in-Molecular-Medicine-and-Life-Sciences/785508702/
jobs.helsinki.fi
Doctoral Researchers in Molecular Medicine and Life Sciences
❤2
#پادکست
#از_R_لذت_ببریم
اپیزود بیستم و پنجم، نهمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
فصل سوم
قسمت بیستم و پنجم:
جستجو و انتخاب بسته های آر
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
نسرین عطار
مهمان خوب این اپیزود خودشون از طرفدارهای پروپاقرص برنامه نویسی در محیط R هستن و علاوه بر ادمینی کانال های تلگرامی جذاب عطار آکادمی و کانال R-Ladies IRAN، از بنیان گذاران و گردانندگان شاخه R-ladies Urmia و عضو فعال از سازمان جهانی R-ladies هستن.
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/yw4zf4rd
@JafaRiLab
#از_R_لذت_ببریم
اپیزود بیستم و پنجم، نهمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
فصل سوم
قسمت بیستم و پنجم:
جستجو و انتخاب بسته های آر
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
نسرین عطار
مهمان خوب این اپیزود خودشون از طرفدارهای پروپاقرص برنامه نویسی در محیط R هستن و علاوه بر ادمینی کانال های تلگرامی جذاب عطار آکادمی و کانال R-Ladies IRAN، از بنیان گذاران و گردانندگان شاخه R-ladies Urmia و عضو فعال از سازمان جهانی R-ladies هستن.
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/yw4zf4rd
@JafaRiLab
❤6
#آگهی
👇👇👇
پست زیر به درخواست یکی از همکاران آورده شده است و محتوای آن ارتباطی با @JafaRiLab ندارد
👇👇👇
https://www.linkedin.com/posts/amir-ata-saei-775262b1_postdoctoral-studies-in-colon-cancer-metabolism-activity-7156013331248476163-Nmtw?utm_source=share&utm_medium=member_desktop
👇👇👇
پست زیر به درخواست یکی از همکاران آورده شده است و محتوای آن ارتباطی با @JafaRiLab ندارد
👇👇👇
https://www.linkedin.com/posts/amir-ata-saei-775262b1_postdoctoral-studies-in-colon-cancer-metabolism-activity-7156013331248476163-Nmtw?utm_source=share&utm_medium=member_desktop
Linkedin
Postdoctoral studies in colon cancer metabolism and its interface with the… | Amir Ata Saei
We are recruiting a postdoctoral fellow to join our emerging lab at Karolinska Institutet. The project is highly multidisciplinary and will apply proteomics…
#پادکست
اپیزود بیستم و ششم، دهمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
فصل سوم
قسمت بیستم و ششم:
پاسخ به داوران
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
فرخ امینی فر
مهمان عزیز این اپیزود عضو هیئت علمی سابق دانشگاه تهران و مشاور ارشد شرکت کوانتا تکنولوژی در سن دیگو در آمریکا هستند. ایشان با اچ ایندکس ۵۱ و بیش از ۹۳۰۰ ارجاع، سابقه فعالیت گسترده ای در انتشار مقاله در حوزه سیستم های قدرت، شبکه های هوشمند و اندازه گیری های همزمان در پانزده سال گذشته داشته اند.
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/242wp5xc
@JafaRiLab
اپیزود بیستم و ششم، دهمین اپیزود از فصل سوم پادکست با نام ویژه ادج (Edge) منتشر شد.
فصل سوم
قسمت بیستم و ششم:
پاسخ به داوران
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
فرخ امینی فر
مهمان عزیز این اپیزود عضو هیئت علمی سابق دانشگاه تهران و مشاور ارشد شرکت کوانتا تکنولوژی در سن دیگو در آمریکا هستند. ایشان با اچ ایندکس ۵۱ و بیش از ۹۳۰۰ ارجاع، سابقه فعالیت گسترده ای در انتشار مقاله در حوزه سیستم های قدرت، شبکه های هوشمند و اندازه گیری های همزمان در پانزده سال گذشته داشته اند.
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید.
لینک این اپیزود در Spotify:
tinyurl.com/242wp5xc
@JafaRiLab
Castbox
Episode 26 - Writing a response to reviewers (پاسخ به داوران)
<p>به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید</p><p>فصل سوم</p><p> </p><p>قسمت بیستم و ششم:</p><p><strong>پاسخ به داوران</strong></p><p>م...
❤3
#مقاله_جدید_ما
عنوان:
طراحی درمان‌های ترکیبی بیمار-محور برای لوکمی میلوئید حاد براساس ادغام کارایی/سمیت و مدل‌سازی شبکه دوبخشی
چکیده:
🔬📊 خوشحالیم که می‌توانیم یافته‌های تازه‌ترین تحقیقات خود را در مورد درمان لوکمیوس میلوئید حاد (AML) به اشتراک بگذاریم! 📚 مقاله جدید ما به بررسی کارایی درمان ترکیبی در مقابله با این سرطان خونی پرخطر پرداخته است.
🩸 این بیماری به دلیل تنوع و مقاومت به درمان‌های تک دارویی چالش‌های قابل توجهی را ایجاد می‌کند. برای حل این مسئله، از مدل‌سازی محاسباتی برای شناسایی ترکیبات دارویی تعاملی استفاده کردیم. رویکرد ما نه تنها به کارایی داروها توجه کرد بلکه به سمیت پتانسیلی آنها نیز پرداخت، که برای موفقیت درمان اساسی است.
💡 با استفاده از نمونه‌های توموری مشتق از بیماران و داروها، یک شبکه دوبخشی ایجاد کردیم که تنوع پاسخ درمانی را خلاصه کرده است. این شبکه به ما کمک کرد تا خوشه‌های دارویی متمایز را پیدا کنیم که هرکدام به فرآیندهای زیستی خاص و مسیرهای مهم برای درمان AML مرتبط هستند.
🧪 چهار دارو با بالاترین کارایی و کمترین سمیت از هر خوشه برای آزمایش‌های بیشتر انتخاب شدند که نتایج جالبی از خود نشان دادند. ترکیب‌های روکسولیتینیب-اولیکسرتینیب و ساپانی‌سرتیب-LY3009120 به عنوان موثرترین ترکیب‌ها، اثرات هم‌افزایی روی سلول‌های بلاست با حداقل سمیت روی سلول های لمفوسیت را نشان دادند.
👩🔬 یافته‌های ما پایه‌های لازم برای درمان‌های شخصی‌سازی شده AML را فراهم می‌کند، که جایگزین‌های بالقوه‌ای برای درمان‌های استاندارد ارائه می‌دهد. با استفاده از ترکیبات دارویی نوآورانه، هدف ما بهبود نتایج بیماران و پیشرفت در مبارزه با AML است.
مجله:
Oncogenesis
📖 مقاله کامل را در اینجا مطالعه کنید https://rdcu.be/dz9Bm و با ما در تلاش برای درمان‌های موثرتر و شخصی‌تر برای بیماران AML همراه شوید!
عنوان:
طراحی درمان‌های ترکیبی بیمار-محور برای لوکمی میلوئید حاد براساس ادغام کارایی/سمیت و مدل‌سازی شبکه دوبخشی
چکیده:
🔬📊 خوشحالیم که می‌توانیم یافته‌های تازه‌ترین تحقیقات خود را در مورد درمان لوکمیوس میلوئید حاد (AML) به اشتراک بگذاریم! 📚 مقاله جدید ما به بررسی کارایی درمان ترکیبی در مقابله با این سرطان خونی پرخطر پرداخته است.
🩸 این بیماری به دلیل تنوع و مقاومت به درمان‌های تک دارویی چالش‌های قابل توجهی را ایجاد می‌کند. برای حل این مسئله، از مدل‌سازی محاسباتی برای شناسایی ترکیبات دارویی تعاملی استفاده کردیم. رویکرد ما نه تنها به کارایی داروها توجه کرد بلکه به سمیت پتانسیلی آنها نیز پرداخت، که برای موفقیت درمان اساسی است.
💡 با استفاده از نمونه‌های توموری مشتق از بیماران و داروها، یک شبکه دوبخشی ایجاد کردیم که تنوع پاسخ درمانی را خلاصه کرده است. این شبکه به ما کمک کرد تا خوشه‌های دارویی متمایز را پیدا کنیم که هرکدام به فرآیندهای زیستی خاص و مسیرهای مهم برای درمان AML مرتبط هستند.
🧪 چهار دارو با بالاترین کارایی و کمترین سمیت از هر خوشه برای آزمایش‌های بیشتر انتخاب شدند که نتایج جالبی از خود نشان دادند. ترکیب‌های روکسولیتینیب-اولیکسرتینیب و ساپانی‌سرتیب-LY3009120 به عنوان موثرترین ترکیب‌ها، اثرات هم‌افزایی روی سلول‌های بلاست با حداقل سمیت روی سلول های لمفوسیت را نشان دادند.
👩🔬 یافته‌های ما پایه‌های لازم برای درمان‌های شخصی‌سازی شده AML را فراهم می‌کند، که جایگزین‌های بالقوه‌ای برای درمان‌های استاندارد ارائه می‌دهد. با استفاده از ترکیبات دارویی نوآورانه، هدف ما بهبود نتایج بیماران و پیشرفت در مبارزه با AML است.
مجله:
Oncogenesis
📖 مقاله کامل را در اینجا مطالعه کنید https://rdcu.be/dz9Bm و با ما در تلاش برای درمان‌های موثرتر و شخصی‌تر برای بیماران AML همراه شوید!
Nature
Designing patient-oriented combination therapies for acute myeloid leukemia based on efficacy/toxicity integration and bipartite…
Oncogenesis - Designing patient-oriented combination therapies for acute myeloid leukemia based on efficacy/toxicity integration and bipartite network modeling
❤9
#مقاله_جدید_ما
عنوان:
یک بررسی انتقادی بر دیتابیس‌های پزشکی سنتی چینی به عنوان منبع کشف دارو
چکیده:
🔍🧬 خوشحالیم که می توانیم نتایج تازه‌ترین تحقیقات منتشر شده خود در زمینه پزشکی سنتی چینی را برای کشف داروها به اشتراک بگذاریم! 📊 مقاله جدید ما به بررسی انتقادی دیتابیس‌های پزشکی سنتی چینی به عنوان منبع کشف دارو پرداخته است.
💊 پزشکی سنتی چینی از چند هزار سال گذشته در حال استفاده است تا بتواند بیماری‌های انسانی را درمان کند. اخیراً، بسیاری از دیتابیس‌ها به مطالعه فارماکولوژی پزشکی سنتی چینی اختصاص یافته‌اند. بیشتر این دیتابیس‌ها شامل اطلاعات در مورد مواد موثره گیاهان پزشکی سنتی چینی و نشانگان بیماری آنها هستند. این دیتابیس‌ها به محققان امکان می‌دهند تا به طور سیستماتیک مکانیسم‌های اثر در پزشکی سنتی چینی را بررسی کنند.
📝با این حال، نیاز به مطالعات مقایسه‌ای از این دیتابیس‌ها وجود دارد، زیرا آنها از منابع مختلفی با روش‌های متفاوت در پردازش داده ایجاد شده‌اند. در این مطالعه، ما یک تجزیه و تحلیل جامع از دیتابیس‌های پزشکی سنتی چینی موجود ارائه می‌دهیم. همچنین، ما جدیدترین دیتابیس‌های پزشکی سنتی چینی حاوی نشانگان پزشکی و بیان ژن ها را مشخص کردیم که اهمیت استفاده از داده‌های امیکس چندگانه و رویکردهای پیشرفته بیوانفورماتیکی برای کشف دارو در پزشکی سنتی چینی را نشان می دهد.
📌به طور خلاصه، چنین مطالعات مقایسه‌ایی درک پیچیدگی داده‌ها را بهبود داده که در نهایت می‌تواند منجر به انتخاب استراتژی‌های کارآمدتر و استانداردتر در راستای دیجیتالی‌شدن پزشکی سنتی چینی بشود.
مجله:
Frontiers in Pharmacology (IF: 5.81; Q1)
📖 مقاله کامل را در اینجا مطالعه کنید و با ما در تلاش برای استفاده بهینه از داده‌های پزشکی سنتی چینی برای کشف داروهای جدید همراه شوید!"
عنوان:
یک بررسی انتقادی بر دیتابیس‌های پزشکی سنتی چینی به عنوان منبع کشف دارو
چکیده:
🔍🧬 خوشحالیم که می توانیم نتایج تازه‌ترین تحقیقات منتشر شده خود در زمینه پزشکی سنتی چینی را برای کشف داروها به اشتراک بگذاریم! 📊 مقاله جدید ما به بررسی انتقادی دیتابیس‌های پزشکی سنتی چینی به عنوان منبع کشف دارو پرداخته است.
💊 پزشکی سنتی چینی از چند هزار سال گذشته در حال استفاده است تا بتواند بیماری‌های انسانی را درمان کند. اخیراً، بسیاری از دیتابیس‌ها به مطالعه فارماکولوژی پزشکی سنتی چینی اختصاص یافته‌اند. بیشتر این دیتابیس‌ها شامل اطلاعات در مورد مواد موثره گیاهان پزشکی سنتی چینی و نشانگان بیماری آنها هستند. این دیتابیس‌ها به محققان امکان می‌دهند تا به طور سیستماتیک مکانیسم‌های اثر در پزشکی سنتی چینی را بررسی کنند.
📝با این حال، نیاز به مطالعات مقایسه‌ای از این دیتابیس‌ها وجود دارد، زیرا آنها از منابع مختلفی با روش‌های متفاوت در پردازش داده ایجاد شده‌اند. در این مطالعه، ما یک تجزیه و تحلیل جامع از دیتابیس‌های پزشکی سنتی چینی موجود ارائه می‌دهیم. همچنین، ما جدیدترین دیتابیس‌های پزشکی سنتی چینی حاوی نشانگان پزشکی و بیان ژن ها را مشخص کردیم که اهمیت استفاده از داده‌های امیکس چندگانه و رویکردهای پیشرفته بیوانفورماتیکی برای کشف دارو در پزشکی سنتی چینی را نشان می دهد.
📌به طور خلاصه، چنین مطالعات مقایسه‌ایی درک پیچیدگی داده‌ها را بهبود داده که در نهایت می‌تواند منجر به انتخاب استراتژی‌های کارآمدتر و استانداردتر در راستای دیجیتالی‌شدن پزشکی سنتی چینی بشود.
مجله:
Frontiers in Pharmacology (IF: 5.81; Q1)
📖 مقاله کامل را در اینجا مطالعه کنید و با ما در تلاش برای استفاده بهینه از داده‌های پزشکی سنتی چینی برای کشف داروهای جدید همراه شوید!"
Frontiers
Frontiers | A critical assessment of Traditional Chinese Medicine databases as a source for drug discovery
Traditional Chinese Medicine (TCM) has been used for thousands of years to treat human diseases. Recently, many databases have been devoted to studying TCM p...
👍7
#از_R_لذت_ببریم
نسخه جدید igraph 2.0.0 منتشر شد! 🚀
این نسخه همزمان با توسعه هسته C منتشر شده است. برای مشاهده تغییرات کامل، به بخش Breaking changes، در این لینک مراجعه کنید.
خلاصه تغییرات:
🔄 تغییر نام تابع: از حالت نقطه ای به حالت ماری (استفاده از زیرخط)
برای ارائه یک رابط منسجم‌تر جایگزین فاصله، توابع igraph که به حالت نقطه‌ای هستند (مانند
در حال حاضر، هر دو گزینه برای هر تابع کار می‌کنند، اما به تدریج توابع نقطه‌ای حذف خواهند شد. ابتدا پیام‌های منسوخ منتشر می‌شوند، سپس در نسخه بعدی هشدار داده می‌شود و در نهایت منجر به خطا خواهد شد.
بنابراین، بهتر است کدهای خود را به روز کنید. 🛠
@JafaRiLab
نسخه جدید igraph 2.0.0 منتشر شد! 🚀
این نسخه همزمان با توسعه هسته C منتشر شده است. برای مشاهده تغییرات کامل، به بخش Breaking changes، در این لینک مراجعه کنید.
خلاصه تغییرات:
🔄 تغییر نام تابع: از حالت نقطه ای به حالت ماری (استفاده از زیرخط)
برای ارائه یک رابط منسجم‌تر جایگزین فاصله، توابع igraph که به حالت نقطه‌ای هستند (مانند
add.edges) منسوخ شده و به صورت توابعی به حالت ماری (مانند add_edges) تغییر کرده اند.در حال حاضر، هر دو گزینه برای هر تابع کار می‌کنند، اما به تدریج توابع نقطه‌ای حذف خواهند شد. ابتدا پیام‌های منسوخ منتشر می‌شوند، سپس در نسخه بعدی هشدار داده می‌شود و در نهایت منجر به خطا خواهد شد.
بنابراین، بهتر است کدهای خود را به روز کنید. 🛠
@JafaRiLab
GitHub
rigraph/src/vendor/cigraph/CHANGELOG.md at 1bd2bf7928b1a406958ee3c82f388132484030bd · igraph/rigraph
igraph R package. Contribute to igraph/rigraph development by creating an account on GitHub.
👍4
#از_R_لذت_ببریم
I've recently discovered a really useful R package by Jan Broder Engler called tidyheatmaps. It's designed to make creating heatmaps from tidy data easy, especially for publication-quality visuals. The package uses pheatmap for detailed heatmaps with less coding.
If you work with data like gene expression, you can get a heatmap set up quickly. The usage is straightforward, allowing for quick customization of your heatmaps.
Check out the full guide for all options: https://jbengler.github.io/tidyheatmaps/
Give it a try for your next data visualization task. It could be a game changer for presenting your data.
If you're interested in statistics, data science, and programming, you might also enjoy my free newsletter where such topics are covered regularly.
https://x.com/JoachimSchork/status/1845455956471152680
I've recently discovered a really useful R package by Jan Broder Engler called tidyheatmaps. It's designed to make creating heatmaps from tidy data easy, especially for publication-quality visuals. The package uses pheatmap for detailed heatmaps with less coding.
If you work with data like gene expression, you can get a heatmap set up quickly. The usage is straightforward, allowing for quick customization of your heatmaps.
Check out the full guide for all options: https://jbengler.github.io/tidyheatmaps/
Give it a try for your next data visualization task. It could be a game changer for presenting your data.
If you're interested in statistics, data science, and programming, you might also enjoy my free newsletter where such topics are covered regularly.
https://x.com/JoachimSchork/status/1845455956471152680
❤4
#یادداشت
https://www.linkedin.com/posts/mohieddinjafari_hupo2024-hupo2024-proteomics-activity-7255040619285233664-QcRp?utm_source=share&utm_medium=member_desktop
https://www.linkedin.com/posts/mohieddinjafari_hupo2024-hupo2024-proteomics-activity-7255040619285233664-QcRp?utm_source=share&utm_medium=member_desktop
Linkedin
Mohieddin Jafari on LinkedIn: #hupo2024 #hupo2024 #proteomics #teamwork #scienceinaction #networking…
Yesterday at #HUPO2024 in Dresden was an exciting and productive day! I'm incredibly proud of my talented team members, Elham Gholizadeh and Ehsan Zangene, for…
❤5👍3
What’s your next step after a manuscript rejection?
Final Results
10%
Write a rebuttal letter to the editor
19%
Submit to a different journal without any change
39%
Submit to a different journal with come modificaitons
26%
Seek advice from peers before revising
6%
Forget the manuscript
JafaRiLab
What’s your next step after a manuscript rejection?
#یادداشت
https://x.com/MohieddinJafari/status/1849392934715617567?t=hUpsNTX-vJXbVQ6MOWV7vg&s=19
توصیه ای که سردبیر journal of proteomics، John Yates در مورد این سوال داره، ارسال مجدد به همان مجله بعد از انجام تغییرات موردنظر داورها است.
https://x.com/MohieddinJafari/status/1849392934715617567?t=hUpsNTX-vJXbVQ6MOWV7vg&s=19
توصیه ای که سردبیر journal of proteomics، John Yates در مورد این سوال داره، ارسال مجدد به همان مجله بعد از انجام تغییرات موردنظر داورها است.
Forwarded from انجمن علمی بیوتکنولوژی
🧬مَسترکلاس پروتئومیکس:
👨💻 «کاوش داده‌های طیف‌سنجی جرمی با بهره‌گیری از زبان برنامه‌نویسی R»
💠 با تدریس:
👤 دکتر محی‌الدین جعفری
⏺ مدیر گروه Systems Pharmacology دانشگاه هلسینکی فنلاند
⏺ دکترای پروتئومیکس کاربردی از دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی
⏺ عضو هیئت علمی اسبق انستیتو پاستور ایران
📝 سرفصل‌ها:
⏺ How does mass spectrometry work?
⏺ Accessing data
⏺ What is raw data in R
⏺ Visualisation of raw MS data
⏺ Raw data processing and manipulation
⏺ Identification data
⏺ Comparing Spectra
⏺ Quantitative data
⏺ Analysis pipeline
🎓 ۱۰ ساعت آموزش حرفه‌ای در قالب ۶ جلسه به‌صورت مجازی در بستر اسکای‌روم
📆 شروع دوره: از هفته اول آذر
👥 مخاطبین: دانشجویان، فارغ‌التحصیلان و پژوهشگران حوزه علوم زیستی، بیوانفورماتیک، داروسازی و...
🥇 همراه با اعطای سرتیفیکیت از شبکه نخبگان ایران
❓سوالات متداول مرتبط با دوره❓
🔥 ثبت‌نام و کسب اطلاعات بیشتر👇 :
🆔 @Biotech_PR
در کانال انجمن علمی بیوتکنولوژی شبکه نخبگان ایران با ما همراه باشید🌱
| @BioTech_Association |
❓سوالات متداول مرتبط با دوره❓
در کانال انجمن علمی بیوتکنولوژی شبکه نخبگان ایران با ما همراه باشید
| @BioTech_Association |
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🤩4❤2
#آگهی
👇👇👇
پست زیر به درخواست یکی از همکاران آورده شده است و محتوای آن ارتباطی با @JafaRiLab ندارد
👇👇👇
بورسیه‌های سه‌ساله توسط Adaptmet برای سال تحصیلی 2025-2026 ارائه می‌شوند که از طریق فراخوان DN–Marie Skłodowska-Curie Actions تأمین مالی می‌گردند. ۱۶ دانشجوی دکتری با انگیزه برای همکاری در پروژه‌های تحقیقاتی انتخاب خواهند شد. برای مطالعه بیشتر به سایت زیر مراجعه کنید:
https://adaptmet.eu/recruitment/
👇👇👇
پست زیر به درخواست یکی از همکاران آورده شده است و محتوای آن ارتباطی با @JafaRiLab ندارد
👇👇👇
بورسیه‌های سه‌ساله توسط Adaptmet برای سال تحصیلی 2025-2026 ارائه می‌شوند که از طریق فراخوان DN–Marie Skłodowska-Curie Actions تأمین مالی می‌گردند. ۱۶ دانشجوی دکتری با انگیزه برای همکاری در پروژه‌های تحقیقاتی انتخاب خواهند شد. برای مطالعه بیشتر به سایت زیر مراجعه کنید:
https://adaptmet.eu/recruitment/
Adaptmet
Recruitment
Recruitment call is now closed 16 positions available in the Adaptmet network and build your future as a researcher in metastasis!
Adaptmet is offering generous three-year fellowships starting in the 2025-202
Adaptmet is offering generous three-year fellowships starting in the 2025-202