#COVID #test

Сейчас каждый день поступает информация о новых тестах на COVID-19. В штатах FDA включила тесты на коронавирус в программу EUA (Emergency Use Authorization), что по сути позволяет лабораториям проводить тесты без бумажной возни. Список включенных в программу тестов постоянно обновляется и доступен по ссылке https://www.fda.gov/emergency-preparedness-and-response/mcm-legal-regulatory-and-policy-framework/emergency-use-authorization

В тоже время сегодня команда из Оксфорда выпустила релиз, что им удалось разработать технологию, которая способна диагностировать COVID за 30 минут. Текущие самые быстрые экспресс тесты (из ссылки выше) на вирусную РНК требовали от 1,5 до 2 часов. Подробнее здесь http://www.ox.ac.uk/news/2020-03-18-oxford-scientists-develop-rapid-testing-technology-covid-19

#telemed

Не было бы счастья, да несчастье помогло. Вместе с коронавирусом зашевелилась российская законодательная система (ну, и канал Медтех). Вчера были отличные новости по поводу онлайн продажи безрецептурных лекарств. В России пытались легализовать дистанционную продажу лекарств несколько лет. Госдума приняла соответствующий законопроект еще в 17, но затем все погрязло в коридорах правительства. 17го числа этот вопрос, наконец, решили.

А сегодня на рбк новость, что ФРИИ направил в правительство пакет поправок к 242-ФЗ разрешающих врачам в рамках телемедицины дистанционно ставить диагнозы и назначать лечение. Время и обоснование как нельзя кстати

https://www.rbc.ru/technology_and_media/19/03/2020/5e72097e9a794721221e1a46?from=from_main

#COVID

Только я вчера сел писать пост про систему эпидемиологического расследования в Сингапуре и то как она круто сработала, как сам столкнулся. Только уже с российской :) жду теперь результаты тестов

#COVID

Пока я уже 4е сутки жду своего экспресс-теста на COVID-19 в Москве поговорим о том, как построено эпидрасследование в Сингапуре. С самого начала они взяли курс на супер-подробный contact tracking и моментальную изоляцию людей из высокой группы риска. В нее входят все, кто контактировал с больным больше 30 минут или на расстоянии менее 2х метров (с симптомами или без — не важно). Каждый covid-положительный кейс расследуется максимально подробно, цель - установить все контакты в течение последних 7 дней. Сначала с пациентом связываются из службы расследований минздрава и интервьюируют около 3х часов. Дальше по каждому кейсу подключается полиция (из Criminal Investigation Department ежедневно работает около 100 сотрудников) и начинается самое интересное. Трекается городская система CCTV (у них стоит порядка 1.5 миллиона камер) включая помещения типа супермаркетов, геолокация (?), сервисы, которым пользовался человек. Таким образом формируется сеть контактов с высоким риском, которая моментально изолируется. В фб много историй о том, что кто-то прокатился на grab 15 минут и на следующий день пришли ребята-космонавты и выписали 14-дневный карантин. Оказалось, что в этот день в этой же машине ехал covid-положительный. В итоге из 243 подтвержденных случаев на 16 марта было изолировано 5711 человек из группы риска.

По ссылке в конце поста отличный материал на тему расследования 3х инфекционных кластеров. Спойлер: средний инкубационный период оказался 4 дня, а большинство случаев заражения пришлось на так называемый "супер-распространителей".

Исследователи проанализировали первые 3 крупных группы случаев COVID-19 в Сингапуре в январе и начале февраля. По всем случаям был проведен более подробный contact tracking (14 дней до изоляции). Кластер A (11 случаев) — китайский магазин всякой дичи, кластер B (20 случаев) бизнес-митинг в одной компании и кластер C (5 случаев) произошел в церкви с двумя посетителями из Ухани. 425 были помещены на карантин и проверены на covid. Из этих контактов только 2, связанные с кластером B, дали положительный результат. Анализ передачи заболевания во всех кластерах выявил средний инкубационный период 4 дня. В одном случае был супер-распространитель, который передал вирус 11 лицам (31% всех случаев передачи), и один еще один вызвал 8 случаев передачи. Прямой физический контакт был выявлен во многих парах передачи. Например, между продавцом и покупателем или во время мероприятий по формированию команды, включая рукопожатие или совместный ланч. Однако в кластере С есть случаи заражения, когда человек сидел на том же месте, что и ранее инфицированный.

Подробнее — https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30528-6/fulltext

#COVID

Ну и вдогонку к предыдущему посту подробнейший дешборд по подтвержденным случаям от минздрава Сингапура https://experience.arcgis.com/experience/7e30edc490a5441a874f9efe67bd8b89

По каждому кейсу есть информация — возраст, национальность (статус), течение болезни, нахождение в больнице и др. Enjoy!

#COVID

Вчера мы говорили о Сингапуре, а сегодня я расскажу вам историю того, как я лично взаимодействую с системой в Москве :)

Эпизод 1. Суббота

В субботу у нашего сотрудника в офисе подтвердился положительный тест на covid-19 и его увезли в Коммунарку. Сразу же в этот день всем, кто работал с ним в одном офисе (мы по сути сидим все за 1 столом — 5 человек), позвонили и спросили адрес и "все ли у вас в порядке"? На вопрос, что нам делать дальше был ответ "ничего". Если у вас нет симптомов, то ничего не делаете. На вопрос нужно ли соблюдать карантин или идти сдавать тесты ответ был в стиле "если нет симптомов то ничего делать и не нужно"

Эпизод 2. Скорая

Утром в воскресенье нам всем позвонили из СП и приехали ко всем домой (напомню — нас 4-ро коллег, кто контактировал с заболевшим). Минут через 40 у меня дома уже была бригада. Померяли температуру — 37.5 + симптомы ОРВИ. Сразу госпитализация. Я начал собираться и в этот момент сотрудники скорой начали спорить, а надо ли вообще меня госпитализировать (мне 32 года, симптомы легкого ОРВИ). В итоге после нескольких звонков начальству они взяли у меня мазки и решили оставить на карантин до 1 апреля. Сказали, что мне перезвонят из поликлиники и возьмут еще повторные анализы и уехали.

Параллельно скорая приехала к моим коллегам. К одному вообще без спец.костюма. Ни у кого симптомов нет. 2м выписали карантин на 14 дней, а одному (sic!) — на 3 дня. Кому то отсчитали карантин с последнего контакта, а кому-то с дня госпитализации нашего коллеги.

Всем нам сказали, что результаты 1го экспресс теста будут через 3-5 дней и чтобы узнать результат можно звонить по горячей линии +74958704509. Забегая вперед если и удастся кому-то туда дозвониться, то там вам на любой конкретный вопрос скажут "мы вы этом не компетентны звоните в роспотрбнадзор". Телефон, конечно, тоже никакой они вам не дадут и предложат воспользоваться гуглом.

Эпизод 3. Повторные анализы

К одному из коллег утром следующего дня (в понедельник) приехал врач из поликлиники взять повторный анализ. Пришел он тоже без спец. костюма. Почему они берут опять анализы, хотя брали вчера — не уточнил. Еще через 2 и через 3 дня пришли за повторными анализами к остальным ребятам.

Эпизод 4. Через 5 дней

Звонит вчера незнакомый номер. Беру трубку:
- Але, Андрей?
- Да
- **** знаете?
- Да
- Он ваш коллега. у него подтвержден коронавирус. Сейчас к вам выедет бригада скорой помощи взять анализ!
- Погодите, но у меня уже взяли анализ дней 5 назад!
- Да? ну тогда извините
- А где мне узнать кстати результат..
- ... короткие гудки

Ни от кого я не могу добиться никакой информации. Я звонил в роспотребнадзор, в поликлиники, в минздрав. Нигде невозможно ничего узнать. В последнем месте на мой вопрос (конечно же, провокационный, ибо достали) "что мне делать если я общался с больным, у меня сейчас температура и кашель сильный" мне ответили "звоните завтра в районную поликлинику и вызывайте врача на дом".

Результатов своего теста я так и не знаю. У меня пока все

p.s. я прекрасно понимаю насколько сейчас перегружена система и в какой стрессовой ситуации она находится. Самое простое, что можно сделать — это организовать адекватный кол-центр со службой одного окна. Где можно проконсультироваться, узнать результаты анализа, спросить элементарные вопросы.

#COVID #mobile #startup

Кому война, а кому мать родная. Поэтому следующие пару дней и постов поговорим о медтех-проектах, связанных с ковидом.

Первая и самая очевидная сейчас история — это реализация трекинга контактов внутри популяции. Сейчас есть 3 основных технологических идеи - использование GPS, данных сотовых операторов и прямой обмен данными между устройствами. В каждой есть свои плюсы и минусы, но сегодня поговорим о 3-й.

2 дня назад со мной связались ребята из https://mepidemics.com/ и нам удалось поговорить о проекте. Если совсем кратко, то они пытаются сделать contact tracker, который ставится на смартфон и в режиме BLE обменивается с соседними смартфонами id'шниками. Тем самым выстраивается граф контактов за 14 дней и если среди контактов есть инфицированный (который как то помечается в системе), то всем прямым контактам приходят пуши.

Сами они описывают юзер-кейс так: "Приложение Mepidemics работает в фоновом режиме и постоянно транслирует ваш id через bluetooth. Когда человек с приложением Mepidemics оказывается рядом с вами, происходит автоматический обмен id. Если у кого-то диагностируют заболевание, все, кто с ним встречался за последние 14 дней, получают уведомления. Для верификации диагнозов, мы привлекаем официальные медицинские организации по всему миру. Чтобы масштабировать регионы присутствия, мы ищем партнерства с локальными больницами и другими медицинскими учреждениями"

Я не супер понимаю, но ребята говорят, что они могут трекать близкий контакт по уровню BLE сигнала (до 2х метров), и в этом конечно самый большой плюс концепта.

Ну а очевидные минусы — это конечно сложность централизованного внедрения такой истории, проблемы с ПД и инфраструктурной связки с системой здравоохранения.

"Мы сосредоточились на обеспечении безопасности закрытых, тесно связанных сообществах. Примерами таких сообществ могут служить: корпорации с большим штатом сотрудников, малые города, моногорода, удаленные регионы, мини государства, острова и т.д. Технологии Mepidemics позволяют за несколько дней дистанционно развернуть систему мониторинга и контроля распространения эпидемий в любой точке мира".

Проект делает международная команда из 6 человек (Гонконг, Англия, Испания, Россия, США) и сейчас разработчики заявляют, что их альфа на модерации в google play. По iOs версии пока нет данных.

P.S. такой проект, конечно, нужно делать open source

#COVID #mobile #startup

Ну не прошло и 2х недель с моего рассказа о MEPEDEMICS, как Apple и Google сколлаборировались и выкатили contact tracking технологию. Концептуально она 1-в-1 как описанная мной в предыдущем посте, но с нюансами относительно шифрования и обеспечения приватности данных.

Система запустится в 2 этапа. Сначала в мае выйдет API и официальные приложения от Apple и Google. Затем в течение следующих месяцев они выпустят это как часть операционной системы и включат глобальную систему треккинга контактов по умолчанию (?).

Apple на сайте выложили короткие спеки https://www.apple.com/covid19/contacttracing/

Конечно, подобное решение от Google и Apple сразу покрывает все недостатки сторонних проектов на эту тему, а их по сути 3

1. Приватность. Мы и так уже отдали все данные, какие только можно Эплу и Гуглу. Не возникает консерна передачи данных 3й стороне

2. Покрытие. Понятно эффективность этой системы пропорциональна ее распространению. Если это будет работать на уровне ОС и по умолчанию, то это вин.

3. B2G. Понятное дело, что заходить с уровня Эпла и Гугла сейчас будет в 1000 раз проще, чем просто классным ребятам из стартапа. Думаю, это будет на уровне рекомендация от ВОЗ.

#COVID #mobile #startup

А вот и новости от google — contact tracking система из прошлого поста подъедет уже в следующем апдейте, начиная с Android 6.0. Google подтвердил, что будет использовать инфраструктуру Google Play Services для обновления телефонов Android с помощью новой системы отслеживания контактов COVID-19, которую он строит в сотрудничестве с Apple.

https://www.theverge.com/2020/4/13/21220033/android-covid-19-tracking-updates-google-play-contact-tracing

#COVID #test

10.04 на сайте Роспотребнадзора появилась информация, что "Вектор" зарегистрировал ИФА тест-систему «SARS-CoV-2-ИФА-Вектор» для определения антител к новому коронавирусу. К сожалению никакой другой информации, включая какой белок используется в качестве антигена, не сообщается.

Тем временем ребята из «НМИЦ гематологии» еще 5.04 писали в фб, что им удалось получить работающий прототип теста на антитела к COVID-19 — https://www.facebook.com/grigory.efimov/posts/3151977588193189. Насколько известно из разрозненных источников, сейчас прототип достаточно чувствительный и специфичный. В качестве антигена используется S-белок

Тест пока проводится в лабораторном формате, и потенциально готов к регистрации (?) и промышленному применению. Возможно ли технологически сделать экспресс тест (тест полоски) пока не понятно

Тест на антитела сейчас один из самых острых вопросов как в эпидемиологическом вопросе, так и в клиническом.

#VC #Finance

Блумберг выпустил отчет о состоянии рынка VC в первом квартале 2020. Если коротко, то за 1Q20 фонды привлекли уже $21B. Для сравнения за весь 19 год сумма была в $51B.

Но интересно другое. Впервые за долгое время упал сектор инвестиций в софтверные стартапы ($9.9B за 1Q20) на целый ярд, по сравнению с тем же периодом прошлого года. Зато выросла фарма и биотех, как раз на этот самый миллиард. $5.7B уже с начала года фонды вложили в медтех.

«Мы не можем смотреть на все только сквозь призму Covid, но многие проблемы, с которыми мы сталкиваемся как общество, будут биологическими по своему характеру, и инновации, которые нам необходимы для борьбы с этими проблемами, сильно поменяют в эту отрасль» , - сказал Хорхе Конде, генеральный партнер Andreessen Horowitz, который инвестирует в биологические компании.

Ну и вторая причина — по сути неэластичность (эй экономисты, так можно говорить?). В то время, как весь рынок падает и творится адовый бардак, например Zentalis Pharmaceuticals проводит IPO на NASDAQ 3 апреля. При заявленной стартовой цене в 18$ они в первый день закрывают 24$.

В прошлом году многие из наиболее успешных IPO состоялись в секторе медтеха, в том числе Avedro Inc. и BioNTech, что подогревает интерес к рынку. Ну и вообще в 19 году 46 медтех компаний проведи IPO и собрали в общей сложности $5.46B

https://www.bloomberg.com/news/articles/2020-04-14/vc-firms-raised-21-billion-last-quarter-despite-pandemic-chaos

#friends

Несколько полезных пятничных ссылок

1. Одно из моих любимых изданий T&P сделали крутую подборку статей об инфекционных заболеваниях

https://www.tg-me.com/tandp_ru/1474

2. Фонд Сколково и AstraZeneca запускают акселератор AstraZeneca - Skolkovo Startup Challenge 2020 с фокусом на:

• проекты и терапевтические решения на ранних и поздних стадиях в области онкологии, сердечно-сосудистых заболеваний, обмена веществ и почек, респираторных и аутоиммунных заболеваний
• проекты в области цифровой медицины
• готовые решения для бизнеса
• проекты и разработки, позволяющие обеспечить поддержку врачей и пациентов в условиях пандемии

https://azchallenge.sk.ru/

#COVID #test

Тест на антитела, про который я писал пару дней назад, готов. Ребята начали клинические испытания

https://www.facebook.com/100001429372112/posts/3180633041994310/?d=n

#COVID #test

Источник - https://www.nytimes.com/2020/04/19/us/coronavirus-antibody-tests.html

Продолжим про тесты на антитела, т.к. сейчас это является одной из важнейших тем в контексте снятия локдаунов. Особенно интересно, что происходит сейчас в Шатах, где Трамп настаивает на том, чтобы как можно быстрее вновь открыть страну, и несколько штатов рассматривают возможность снятия блокировок в ближайшие несколько недель.

Сразу небольшое отступление для тех, кто не погружался в эту тему. Если кратко, то иммунный ответа на covid-19 содержит антитела иммуноглобулины
IgM и IgG. При этом IgM-антитела к SARS-CoV-2, как правило, выявляются в крови через несколько дней после заражения, хотя как он ведет себя во время активной фазы covid до сих пор плохо изучены. Антитела IgG обычно выявляются через 10–14 дней после заражения, хотя они могут быть обнаружены раньше и обычно достигают пика примерно через 28 дней после начала инфекции. Подробнее - https://www.fda.gov/media/136622/download

После первых недель эпидемии и больших проблем с одобренными пцр-тестами на covid-19 в штатах FDA очень спешно врубила программу программу EUA (Emergency Use Authorization), которая позволила проходить супер-ускоренную регистрацию тестов в США, по сути не дожидаясь одобрения самого FDA (Я писал об этом ранее https://www.tg-me.com/medtechnews/180). Несколько недель назад в программу быстро включили тесты на антитела. FDA разрешило около 90 компаниям (большинство - китайские), продавать тесты, которые по сути не проходили никакой проверки.

На рынок тут же вылились сотни тысяч тестов крайне сомнительного качества, а большое количество компаний и гос.органов кинулись закупить их и тестировать персонал. При чем, как лабораторных, так и экспресс PoCT ( point-of-care testing). К последним, как раз, самое большое количество вопросов. По словам источников в FDA часть из "пред-одобренных" тестов имеют крайне низкую чувствительность, чуть ли не 20%.

Вторая большая проблема - у большинства тестов (особенно экспресс) не понятный механизм действия. Вот прямо так - на рынке США продаются тесты, которые определяют только IgM-антитела. Т.е. положительный тест может быть просто у бессимптомного больного, а не переболевшего с устойчивым (?) иммунитетом.

По некоторым данным сейчас в штатах симптомно или бессимптомно перенесли covid менее 5% населения. В Китае ранний скрининг в сильно пострадавшем Ухане показывает, что только около 3х процентов населения имеет антитела. Короче говоря, на таком низком проценте супер-важен процент ложноположительных случаев. А тут даже у заапрувленного FDA теста от Cellex (всего на сегодня FDA официально утвердила 4 теста) специфичность 95,6% и чувствительность 93,8%. (https://www.centerforhealthsecurity.org/resources/COVID-19/serology/Serology-based-tests-for-COVID-19.html) Это значит, что на масштабном тестировании количество ложноположительных тестов будет примрено равно реальному количеству переболевших. Есть ли вообще смысл в таком тестировании - вопрос риторический.

#COVID #mobile

https://howwefeel.org/

Крайне странную штуку промоутит Pinterest - приложение How we feel. Это приложение собирает обезличенные данные (запрашивает только гео-локацию или просит ввести ZIP-код) о вашем анамнезе и последних контактах. Сначала нужно ответить на около 20 вопросов и потом каждый день отмечать как ты себя чувствуешь. Если, конечно, вам повезет и приложение не скрашится на последнем вопросе. Мне вот не позвезло🙂 По задумке создателей (а под это дело они резвернули целый фоундейшн The How We Feel Project) они собирают большую дату в реальном времени по симптомам ковида. Дальше этой датой они делятся с организациями, котрые запросят у них доступ. Занимательно, конечно, но проблема опять же только 1 - охват. Ну т.е. даже Пинтерест явно не даст такого охвата, чтобы это было реально полезно.