Геномы растений претерпели полногеномные дупликации, которые во многих случаях сохранились в виде крупных дуплицированных участков или блоков синтении. Ученые из США провели опыты на арабидопсисе и показали, что «возврат» к недуплицированному геному не нарушает жизнеспособность растения. С помощью SpCas9 авторы удалили четыре крупных блока дупликаций размером от 115 до 684 тысяч пар оснований. Три из четырех блоков ученые нокаутировали полностью, а для оставшегося получили гетерозиготную делецию — такие результаты указывают на избыточность или модульность растительных геномов.
Подробнее

#новости

Плазмидную ДНК широко применяют в генной терапии, но стоимость ее производства достигает 100 тыс. долларов за грамм. Исследователи из США провели мутагенез генома E. coli, чтобы повысить выработку плазмид бактериальной клеткой. В результате число репортерных плазмид, экспрессирующих GFP, выросло в 5,93 раза, число плазмид gWiz, разработанных для экспрессии в клетках млекопитающих, — в 1,93 раза, а аденоассоциированного вирусного вектора pAAV-CAGG-eGFP — в 8,7 раза. Причина такого роста — в том числе мутация R584H в гене recG, кодирующем хеликазу. Если убрать мутацию из генома бактерии, то число плазмид снизится на 63%. Подробнее

#новости

HAR (human-accelerated regions) — участки генома, консервативные у млекопитающих, но претерпевшие ускоренные эволюционные изменения в человеческой линии после расхождения с шимпанзе. Ученые из США показали, что HAR123, расположенный в интроне гена SMG6, функционирует как энхансер, способствует формированию клеток-предшественников нейронов и при их дальнейшем развитии увеличивает соотношение нейронов к глиальным клеткам. Нокаут HAR123 у мышей приводит к снижению когнитивной гибкости и уменьшению количества нейронов относительно глии в гиппокампе. Подробнее.

#новости

Исследователи из США представили дезинфицирующий гель для рук, высвобождающий оксид азота (NO). По эффекту он сравним со спиртосодержащими дезинфицирующими средствами, но при этом сохраняет противомикробное действие в течение двух часов. В гель, который назвали NORel, входят также этанол, масло чайного дерева и глицерин. Подробнее

#коротко

Цитокины — крайне важные для Т-клеток сигнальные молекулы. «Алфавит» их сигналов мог бы быть куда шире, если бы варианты сигнальных путей JAK-STAT, которые активируются при узнавании цитокина рецептороv, опирались и на неканонические взаимодействия. «Расширением» этого алфавита занялись ученые из Стэнфорда (США), опубликовавшие статью в Nature. Они получили T-клетки с химерными вариантами цитокиновых рецепторов, не встречающихся в природе, и показали, что внутриклеточные механизмы их активации выходят за рамки тех, которые индуцируются естественными цитокинами. Разработку предлагают применять, в частности, для лечения онкозаболеваний — ее уже протестировали на мышиных моделях рака.
Подробнее

#новости

Альтернирующая гемиплегия детского возраста — редкое тяжелое заболевание с неврологическими симптомами, вызванное мутациями в гене субъединицы натрий-калиевой АТФазы. Генная терапия с доставкой гена в нейроны не привела к клиническому улучшению на мышиных моделях заболевания. Однако праймированное редактирование в клетках мозга in vivo смягчило симптомы у мышей и увеличило продолжительность их жизни.

#новости

Повышение точности редактирования генома с помощью ИИ, вред непредвиденного голодания по сравнению с регулярным, энгейджеры Т-клеток для терапии солидных опухолей, гиперполяризация мембран фибробластов для стимуляции роста волос и многое другое — в воскресном обзоре.

#воскресноечтение

Полигенная оценка рисков (PRS) позволяет учитывать совокупное влияние множества генетических вариантов на вероятность развития признака. Ученые из Австралии представили подход GxEprs, который показал, что предсказательную силу PRS можно улучшить, если учесть факторы среды и образа жизни (GxE). Они оценили влияние таких факторов, как питание, физическая активность, курение и потребление алкоголя, на количественные признаки, связанные с ожирением, и сопутствующие заболевания. Оказалось, что учет GxE-компоненты повышает точность прогнозов для количественных признаков, особенно индекса массы тела, окружности талии и процента жира, но прогнозирование заболеваний улучшает незначительно. Подробнее

#новости

ЭПИДДАЙДЖЕСТ — Менингококковая инфекция в Ставропольском крае, геморрагическая лихорадка с почечным синдромом в Удмуртии, энтеровирусная инфекция и вспышка сальмонеллеза в Томской области, ботулизм в Астраханской области, а также вспышка кори в Израиле и аутохтонные случаи малярии на острове Майотта в Индийском океане.

#эпиддайджест

Десмопластическая меланома — редкий подтип меланомы кожи, характеризующийся высокой мутационной нагрузкой и выраженной лимфоцитарной инфильтрацией, что делает ее чувствительной к иммунотерапии. В ходе клинического исследования фазы 2 SWOG S1512 оценили эффективность ингибитора PD-1 — пембролизумаба — у пациентов с неоперабельной десмопластической меланомой. Монотерапия обеспечила высокую частоту полных и частичных ответов, а также длительную общую выживаемость и выживаемость без прогрессирования. Несмотря на существенную токсичность терапии, авторы предлагают рассматривать ее в качестве подходящей стратегии при этой разновидности рака.
Подробнее

#новости

Остео-одонто-кератопротезирование (ООКП) — редкая и сложная операция по восстановлению зрения, в которой основой для глазного импланта служит зуб пациента. Недавно такую операцию впервые успешно провели в Канаде, а в июле на страницах BMJ Ophtalmology опубликовали ретроспективное исследование долгосрочных наблюдений за пациентами с таким имплантом.
Подробнее

#коротко

Исследователи из Китая обнаружили, что силикатные мембраны, применяемые для выделения нуклеиновых кислот, могут стать источником парвовирусов и других вирусных загрязнений. Контаминация способна создать ложные ассоциации между вирусами и хозяевами в метагеномных исследованиях, затруднить диагностику и мониторинг. Подробнее

#коротко

Мозг животных воспринимает стимулы от разных органов чувств, обрабатывая множество сигналов параллельно. Авторы статьи, опубликованной в Nature Human Behaviour, показали, что зрительные и слуховые сигналы обрабатываются независимо друг от друга, но их одновременное действие ускоряет моторную реакцию. Это меняет прежние представления об интеграции разных стимулов — считалось, что зрительные и слуховые сигналы сливаются и только в суммированном виде вызывают реакцию. Свежие данные точнее описывают, как мозг принимает решения и реагирует на сложные стимулы.
Подробнее

#новости

Сотрудники научных центров США и компании SparX Biopharmaceutical исследовали действие моноклонального антитела к цитруллинированному гистону Н3 (CitH3) на мышиной модели сепсиса. Антитело существенно снизило смертность животных как при инфекции синегнойной палочкой, так и при введении летальной дозы бактериальных липополисахаридов. Исследователи также определили терапевтическое окно для применения антитела и описали эффект CitH3 на молекулярном уровне. Подробнее.

#новости

Первое правило — читать статьи. Причем оригинальные тексты, не компиляцию от ChatGPT — он плохо справляется, хотя сейчас уже лучше, близок к среднестатистическому студенту. Читать статьи не только по своей теме, а из близкой области, а может быть, и не из близкой. Раз в день за завтраком читайте по одной статье из Nature Nanotechnology или Nature Biotechnology. Возьмите самые крутые журналы, осильте абстракт, введение и первую картинку. — Виктория Шипунова в рубрике ЗАВЛАБЫ

#завлабы
#интервью

Международное исследование, проведенное в 18 странах, показало, что перенесенная инфекция COVID-19 связана с ускоренным старением сосудов, особенно у женщин. Через шесть месяцев у переболевших отмечалось значимое повышение жесткости стенок артерий по сравнению с контрольной группой, даже при легком течении заболевания. Наиболее выраженные изменения выявлялись у женщин, госпитализированных в отделение интенсивной терапии, или пациенток с долгим ковидом. Вакцинация имела защитный эффект и ассоциировалась с менее ускоренным старением, а спустя год после болезни состояние сосудов частично восстановилось.
Подробнее

#новости

В журнале Nature Microbiology опубликована статья о сообществах микроорганизмов, которые ферментируют какао-бобы. Эти микроорганизмы до сих пор оставались малоизученными, поскольку ферментация происходит естественным образом. Метагеномное секвенирование образцов с трех ферм помогло выделить минимальное сообщество микроорганизмов (пять изолятов бактерий и четыре изолята грибков), которое при ферментировании воспроизводит вкусовые качества шоколада премиум-класса. Подробнее.

#новости